중도퇴사자 연말정산 하는 법 2026, 미취업은 5월 신고?

중도퇴사자 연말정산 하는 법은 딱 두 갈래입니다. 퇴사한 해(2026년) 안에 재취업했다면 새 회사에 전 직장 근로소득 원천징수영수증을 내서 2027년 1~2월 연말정산 때 합산하고, 연말까지 재취업하지 못했다면 2027년 5월 종합소득세 확정신고로 빠진 공제를 직접 넣어 환급받습니다.

📌 중도퇴사자 연말정산 한눈에 보기

• 퇴사 달 급여 때 회사가 한 정산 = 자료를 안 냈으면 기본공제 위주, 보험료·의료비·카드 등은 빠지기 쉬움
• 같은 해 재취업 → 새 회사에 전 직장 원천징수영수증 제출 → 합산 연말정산
• 재취업 못 함 → 다음 해 5월 1일~31일 종합소득세 신고(2026년엔 5월 31일이 일요일이라 6월 1일까지였음)
• 보험료·의료비·교육비·카드는 근무한 기간 지출분만, 기부금·연금저축은 1년치
• 5월도 놓쳤다면 5년 안에 경정청구

중도퇴사자 연말정산, 내 상황은 어디에 해당하나?

기준은 "퇴사한 해 12월 31일 현재 근로자인가"입니다. 회사에 다니고 있으면 새 회사가, 다니지 않으면 본인이 5월에 정산합니다.

먼저 아래 표에서 내 경우를 찾으면 해야 할 일이 정해집니다. 퇴사 후 프리랜서(3.3%)나 사업을 시작했다면 근로소득과 함께 5월에 합산 신고해야 하므로, 새 회사 연말정산만으로 끝나지 않습니다.

퇴사 후 상황	누가 정산하나	언제	준비할 것
같은 해 재취업(근로자)	새 회사	다음 해 1~2월 연말정산	전 직장 근로소득 원천징수영수증
연말까지 미취업	본인	다음 해 5월 종합소득세 신고	원천징수영수증, 간소화 자료, 간소화에 없는 영수증
프리랜서·사업 시작	본인	다음 해 5월 종합소득세 신고(합산)	원천징수영수증 + 사업·프리랜서 소득 자료
재취업했지만 합산을 못 함	본인	다음 해 5월 종합소득세 신고	두 회사 원천징수영수증 모두

전 직장 원천징수영수증을 아직 못 받았다면 근로소득 원천징수영수증 발급 방법(홈택스·퇴사자)에서 회사 요청법과 홈택스 지급명세서 출력법을 먼저 확인하세요.

퇴사 때 회사가 한 중도퇴사 연말정산, 무엇이 빠졌나?

회사는 퇴직하는 달 급여를 줄 때 그해 받은 급여로 연말정산을 끝냅니다. 이때 공제 자료를 내지 않았다면 기본공제 위주로만 계산돼, 받을 수 있던 공제가 빠진 상태일 가능성이 큽니다.

그래서 원천징수영수증의 결정세액과 기납부세액을 꼭 보세요. 결정세액보다 이미 낸 세금이 많으면 환급, 적으면 추가 납부가 생깁니다. 퇴사 후 공제를 더 넣으면 결정세액이 줄어 환급이 늘어납니다.

주의할 점은 공제마다 인정되는 기간이 다르다는 것입니다. 국세청 안내에 따르면 보험료·의료비·교육비·주택자금·신용카드 등은 근로를 제공한 기간에 쓴 금액만 공제되고, 입사 전이나 퇴사 후에 쓴 돈은 빠집니다.

구분	해당 공제	퇴사 후 지출분
근무 기간 지출분만	보험료, 의료비, 교육비, 주택자금, 신용카드 등 사용액	공제 안 됨
1년 전체 금액	기부금, 연금저축·IRP 등 연금계좌	공제 됨
요건만 맞으면	인적공제(1인당 150만원)	해당 연도 기준으로 판단

종교단체 기부처럼 간소화 자료에 안 뜨는 기부금은 기부금 영수증 발급 방법대로 미리 받아 두면 5월 신고 때 바로 넣을 수 있습니다. 공제 항목별 한도와 공제율 자체가 궁금하다면 2027 연말정산 총정리 공제항목·환급 계산법을 함께 보세요.

재취업했다면 새 회사에 무엇을 언제 내나?

새 회사 연말정산(2027년 1~2월) 전에 전 직장 근로소득 원천징수영수증을 인사·급여 담당자에게 내면 됩니다. 두 회사 급여가 합산돼 1년치로 다시 계산됩니다.

1. 전 직장 서류 받기 — 근로소득 원천징수영수증을 받습니다. 회사에 따라 근로소득원천징수부 사본을 함께 달라고 하는 곳도 있으니 새 회사 담당자에게 먼저 물어보세요.
2. 새 회사 연말정산 일정 전에 제출 — 보통 1월 중 공제 서류를 걷을 때 함께 냅니다. 이때 간소화 자료도 전 직장 근무 기간까지 포함해 내야 합니다.
3. 합산 결과 확인 — 새 회사가 발급하는 원천징수영수증의 근무처별 소득 명세에 전 직장이 들어갔는지 봅니다.

⚠️ 전 직장 소득을 합산하지 않고 새 회사 연말정산만 끝내면, 두 곳 이상에서 받은 근로소득을 신고하지 않은 상태가 됩니다. 이 경우 5월 종합소득세 신고로 직접 합산해야 가산세를 피할 수 있습니다.

재취업 못 했다면 5월 종합소득세 신고 어떻게 하나?

2026년에 퇴사하고 연말까지 일을 쉬었다면 2027년 5월 종합소득세 신고 기간에 홈택스·손택스에서 직접 신고합니다. 2027년 정확한 일정은 국세청 발표를 확인하세요(2026년은 5월 1일~6월 1일).

근로소득만 있는 경우 회사가 낸 지급명세서가 신고서에 불러와지므로, 빠진 공제만 더 넣는 방식으로 진행됩니다. 아래 순서대로 따라하면 됩니다.

1. 1월 간소화 자료 내려받기 — 다음 해 1월 중순 연말정산 간소화 서비스가 열리면 의료비·카드·보험료 자료를 내려받아 둡니다. 퇴사일 이후 지출은 공제에서 빼야 하니 월별 내역을 확인하세요.
2. 간소화에 없는 영수증 모으기 — 안경·콘택트렌즈 구입비, 종교단체 기부금 등은 영수증을 따로 받아야 합니다.
3. 홈택스 로그인 → 종합소득세 신고 화면 들어가기 — 세금신고 메뉴의 종합소득세 신고에서 정기신고를 고릅니다(메뉴 이름은 해마다 바뀔 수 있음). 손택스 앱에서도 같은 신고가 됩니다.
4. 근로소득 불러오기 → 공제 입력 → 제출 — 전 직장 근로소득이 자동으로 뜨는지 확인한 뒤 인적공제·특별공제·기부금 등을 입력하고 제출합니다. 환급세액이 나오면 환급 계좌를 적습니다.
5. 개인지방소득세 신고까지 마무리 — 종합소득세 신고 후 지방소득세 신고도 따로 해야 합니다. 2026년부터 지방소득세를 신고하지 않으면 무신고가산세가 붙을 수 있다고 안내됐습니다.

신고 때 전 직장 급여 총액이 의심되면 소득금액증명원 발급 방법으로 국세청에 신고된 소득을 대조할 수 있습니다. 실업급여는 비과세라 근로소득에 합치지 않지만, 받는 중이라면 실업인정 신청 방법 일정도 함께 챙기세요.

👉 퇴사 후 해야 할 일 7가지 체크리스트 보기

5월 신고도 놓쳤다면 언제까지 돌려받나?

5월을 놓쳐도 끝이 아닙니다. 회사가 중도퇴사 연말정산을 해 둔 근로소득은 신고한 것으로 보기 때문에, 법정신고기한부터 5년 안에 경정청구로 빠진 공제를 넣어 환급을 신청할 수 있습니다.

예를 들어 2026년 귀속분은 2027년 5월 신고기한 다음 날부터 5년 동안 청구할 수 있습니다. 홈택스 경정청구 화면에서 하는 순서는 연말정산 경정청구 방법 따라하기에 정리돼 있습니다.

놓친 상황	방법	기한
퇴사 후 공제 누락(근로소득만)	경정청구	법정신고기한부터 5년
두 회사 소득을 합산 안 함	종합소득세 신고(기한 후면 기한후신고)	빠를수록 가산세 부담 감소
지방소득세만 빠뜨림	지방소득세 신고	종합소득세와 같은 기한

중도퇴사자 연말정산 자주 묻는 질문

Q. 중도퇴사자 연말정산 안 하면 어떻게 되나요?

근로소득만 있었다면 회사가 퇴사 때 정산을 끝냈기 때문에 가산세가 생기지는 않습니다. 다만 빠진 공제만큼 환급을 못 받는 것이니, 5월 종합소득세 신고나 5년 안 경정청구로 챙기는 게 유리합니다.

Q. 퇴사 후 쓴 카드값이나 병원비도 공제되나요?

안 됩니다. 신용카드·의료비·보험료·교육비는 근무한 기간에 쓴 금액만 공제됩니다. 기부금과 연금저축 납입액은 1년치가 인정됩니다.

Q. 재취업한 회사에 전 직장 원천징수영수증을 안 내면요?

두 회사 소득이 합산되지 않아 세금이 덜 계산될 수 있고, 합산 신고 누락으로 가산세가 붙을 수 있습니다. 새 회사 정산 때 못 냈다면 5월 종합소득세 신고로 직접 합산하세요.

Q. 중도퇴사자 5월 종합소득세 신고는 언제 하나요?

퇴사한 다음 해 5월 1일부터 31일까지가 원칙입니다. 2026년에는 5월 31일이 일요일이라 6월 1일까지였고, 2027년 일정은 국세청 발표를 확인하세요.

Q. 전 직장이 폐업해서 원천징수영수증을 못 받으면요?

회사가 지급명세서를 국세청에 냈다면 홈택스에서 근로소득 지급명세서를 조회·출력할 수 있습니다. 조회가 안 되면 관할 세무서에 문의하세요.

출처 안내
국세청·홈택스 연말정산 및 종합소득세 신고 안내, 소득세법(근로소득 연말정산·확정신고 규정), 대한민국 정책브리핑 국세청 중도퇴사자 안내, 세정신문 종합소득세 신고 세무일지를 바탕으로 정리했습니다. 신고 일정과 홈택스 메뉴 이름은 해마다 바뀔 수 있으니 신고 전에 국세청 공지(국번 없이 126)를 확인하세요. 개인 상황에 따라 세액이 다르므로 이 글은 일반 안내입니다.